MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 chromosome 2

Total Repeats: 3135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007494	GGC	2	6	38	43	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007494	GCG	2	6	84	89	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007494	TGG	2	6	221	226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007494	CGA	2	6	245	250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007494	GAT	2	6	270	275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007494	GCA	2	6	319	324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007494	ACC	2	6	430	435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_007494	AGA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007494	CAG	2	6	462	467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007494	GA	3	6	603	608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007494	GGA	2	6	653	658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007494	GGC	2	6	673	678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007494	GTC	2	6	772	777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007494	GCA	2	6	780	785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007494	AC	3	6	798	803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007494	CA	3	6	985	990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007494	TGC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007494	GTC	2	6	1005	1010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007494	TCGTG	2	10	1014	1023	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007494	GGA	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007494	AC	3	6	1168	1173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007494	AC	3	6	1315	1320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007494	AGG	2	6	1378	1383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007494	CCT	2	6	1460	1465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007494	CCG	2	6	1597	1602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007494	GGT	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007494	TCC	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007494	CCA	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007494	CGG	2	6	1772	1777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007494	GCCAGC	2	12	1785	1796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007494	CCA	2	6	1882	1887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007494	TGG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007494	AG	3	6	1958	1963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007494	ACA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007494	CGA	2	6	2057	2062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007494	GATCA	2	10	2126	2135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007494	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007494	GCA	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007494	GGA	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007494	TAG	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007494	GCGA	2	8	2417	2424	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007494	GCCA	2	8	2472	2479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007494	ACC	2	6	2565	2570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_007494	CGA	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007494	G	6	6	3007	3012	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007494	GAT	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007494	AC	3	6	3095	3100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007494	CGTC	2	8	3113	3120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007494	AAC	2	6	3132	3137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007494	AGG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007494	AGC	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007494	GCG	2	6	3277	3282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007494	TG	3	6	3370	3375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007494	CAC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007494	GC	3	6	3436	3441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007494	CA	3	6	3449	3454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007494	GA	3	6	3494	3499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007494	GA	3	6	3541	3546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007494	AGG	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007494	GCT	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007494	GA	3	6	3802	3807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007494	AGG	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007494	G	6	6	3884	3889	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007494	AGG	2	6	3992	3997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007494	CGG	2	6	4029	4034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007494	TG	3	6	4149	4154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007494	GGT	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007494	ACC	2	6	4300	4305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_007494	TCCGGG	2	12	4340	4351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007494	GTG	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007494	GC	3	6	4407	4412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007494	TGG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007494	GTC	2	6	4442	4447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007494	GGT	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007494	TGA	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007494	CTCAT	2	10	4637	4646	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_007494	CGT	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007494	TGG	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007494	ACC	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007494	GCA	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007494	TGT	2	6	5094	5099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007494	TCT	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007494	TGG	2	6	5116	5121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007494	ATCCC	2	10	5145	5154	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_007494	CGC	2	6	5218	5223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007494	AGC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007494	TGG	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007494	GAC	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007494	CGGA	2	8	5436	5443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_007494	GAG	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007494	CG	3	6	5488	5493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007494	CGTC	2	8	5566	5573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007494	CGC	2	6	5603	5608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007494	CAG	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007494	CCT	2	6	5629	5634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007494	GCGCT	2	10	5636	5645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007494	TCA	2	6	8040	8045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007494	CGC	2	6	8085	8090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007494	CG	4	8	8138	8145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007494	AT	3	6	8163	8168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007494	GAA	2	6	8297	8302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007494	CG	3	6	8309	8314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007494	TC	3	6	9420	9425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_007494	CGG	2	6	9475	9480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007494	GCC	2	6	9490	9495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007494	GGAC	2	8	9500	9507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007494	ATC	2	6	9554	9559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007494	CG	3	6	9575	9580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_007494	AGAA	2	8	9611	9618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007494	GCA	2	6	9672	9677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007494	TGC	2	6	9709	9714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007494	GCG	2	6	13212	13217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007494	GGC	2	6	13226	13231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007494	CCA	2	6	13247	13252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_007494	GCCG	2	8	13270	13277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007494	CG	3	6	13276	13281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007494	GCC	2	6	13282	13287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007494	GGC	2	6	13289	13294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007494	CCG	2	6	13394	13399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007494	AGTG	2	8	13413	13420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007494	GCC	2	6	13543	13548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_007494	G	6	6	13582	13587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007494	CT	3	6	13613	13618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007494	CTC	2	6	13657	13662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_007494	TTTC	2	8	13677	13684	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007494	AAGG	2	8	13884	13891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007494	CGC	2	6	13893	13898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007494	TGC	2	6	13934	13939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007494	CT	3	6	13959	13964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007494	CCG	2	6	14020	14025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_007494	TC	3	6	14128	14133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007494	ATCGGA	2	12	14134	14145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007494	CGG	2	6	14147	14152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007494	TTG	2	6	14330	14335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007494	TCGCG	2	10	14347	14356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007494	CGGA	2	8	14389	14396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007494	CTG	2	6	14447	14452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007494	CTT	2	6	14472	14477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007494	AGG	2	6	14496	14501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007494	CGA	2	6	14520	14525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007494	GC	3	6	14537	14542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007494	AG	3	6	14555	14560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007494	GCG	2	6	14580	14585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007494	GGC	2	6	14594	14599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007494	TGTCG	2	10	14699	14708	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007494	CG	3	6	14737	14742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_007494	GTT	2	6	14792	14797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007494	GCG	2	6	14798	14803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007494	GGT	2	6	14804	14809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007494	C	6	6	14816	14821	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_007494	TGC	2	6	14861	14866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007494	GCG	2	6	14874	14879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_007494	GCA	2	6	14886	14891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007494	GCA	2	6	14898	14903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_007494	GA	3	6	14999	15004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007494	CCG	2	6	15053	15058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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158	NC_007494	ACG	2	6	15146	15151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_007494	GCA	2	6	15170	15175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_007494	CCG	2	6	16224	16229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_007494	GC	3	6	16265	16270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_007494	CCGG	2	8	16274	16281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
166	NC_007494	G	7	7	17134	17140	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007494	CCGG	2	8	17174	17181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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184	NC_007494	G	6	6	25875	25880	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
185	NC_007494	CGG	2	6	25892	25897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_007494	GCC	2	6	28873	28878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_007494	T	6	6	28883	28888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_007494	GCC	3	9	29268	29276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
198	NC_007494	GA	3	6	29286	29291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_007494	G	6	6	37557	37562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
294	NC_007494	AGG	2	6	37665	37670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_007494	CGG	2	6	37702	37707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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297	NC_007494	GGT	2	6	37920	37925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_007494	CGC	2	6	46025	46030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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427	NC_007494	CAT	2	6	46186	46191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_007494	TGT	2	6	48904	48909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_007494	GGT	3	9	48917	48925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_007494	CGGCC	2	10	49481	49490	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
433	NC_007494	GCG	2	6	49506	49511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_007494	TCC	2	6	50699	50704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_007494	GGC	2	6	52816	52821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_007494	ACG	2	6	52862	52867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_007494	TCC	2	6	52988	52993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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441	NC_007494	GGA	2	6	53177	53182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
442	NC_007494	TCC	2	6	54866	54871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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449	NC_007494	GCC	2	6	56803	56808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_007494	GCAG	2	8	56889	56896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
452	NC_007494	GA	3	6	56996	57001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_007494	CGG	2	6	59949	59954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_007494	CGCC	2	8	61600	61607	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
463	NC_007494	TCG	2	6	61671	61676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_007494	GA	3	6	61731	61736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
465	NC_007494	GTC	2	6	61796	61801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_007494	CGTCC	2	10	61822	61831	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
467	NC_007494	GCC	2	6	61847	61852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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469	NC_007494	AT	3	6	62749	62754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_007494	CAG	2	6	66610	66615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_007494	CCGA	2	8	71690	71697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
482	NC_007494	CGT	2	6	71715	71720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_007494	GCA	2	6	71732	71737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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